SARS-CoV-2: Hoe ernstig is B.1.1.529-variant, nou genaamd Omicron

Die B.1.1.529-variant is op 24 vir die eerste keer vanuit Suid-Afrika by die WGO aangemeld^th November 2021. Die eerste bekende bevestigde B.1.1.529-infeksie was van 'n monster wat op 9 versamel is^th November 2021¹. Nog 'n bron² dui aan dat hierdie variant die eerste keer opgespoor is in monsters wat op 11 versamel is^th November 2021 in Botswana en op 14^th November 2021 in Suid-Afrika. Sedertdien het die aantal COVID-19-gevalle skerp toegeneem in byna alle provinsies in Suid-Afrika. Soos op 27^th November 2021, nuwe gevalle van hierdie variant is ook aangemeld in België, Hong Kong, Israel, Verenigde Koninkryk³, Duitsland, Italië en Tsjeggiese Republiek wat almal reisverwant van oorsprong is.  

Dankie aan die Suid-Afrikaanse owerhede wat geen tyd geneem het om relevante inligting met die wêreldwye wetenskaplike gemeenskap te kommunikeer en te deel sodat die WGO se deskundige groep op 26^th November 2021 en wys hierdie variant vinnig aan as 'n Variant of concern (VOC). Die erns van die saak kan bepaal word uit die feit dat B.1.1.529 slegs twee dae gelede op 24 as 'n variant onder monitering (VUM) aangewys is.^th November 2021 voordat dit op 26 as VOC aangewys is^th November 2021 sonder om eers as variant onder ondersoek (VOI) aangewys te word.  

Tabel: SARS-CoV-2-variante van kommer (VOC) soos op 26 November 2021 

Die dringendheid om B.1.1.529 as 'n variant van kommer (VOC) aan te wys, was geregverdig omdat daar gevind is dat hierdie variant die mees uiteenlopende variant van SARS-CoV-2 tot dusver is. In vergelyking met die SARS-CoV-2-virus wat oorspronklik in Wuhan, China, opgespoor is, het dit soveel as 30 aminosuurveranderinge, 3 klein delesies en 1 klein invoeging in die piekproteïen. Uit hierdie veranderinge is 15 geleë in die reseptorbindingsdomein (RBD), die deel van die virus wat dit toelaat om toegang tot menslike selle te verkry, wat tot infeksie lei. Hierdie variant het ook 'n aantal veranderinge en delesies in ander genomiese streke². Die mutasies is so omvangryk dat 'n mens dit 'n nuwe stam kan noem, in plaas van 'n variant. Die ongelooflike hoë hoeveelheid piekmutasies beteken 'n groter moontlikheid om van bekende teenliggaampies te ontsnap wat hierdie variant 'n saak van ernstige kommer maak⁵.  

Die verandering na nuwe variante is algemeen vir koronavirusse. Dit was nog altyd die natuur van die koronavirusse om teen uiters hoë tempo mutasie in hul genome te ondergaan, weens 'n gebrek aan proeflees-nuklease-aktiwiteit van hul polimerase; meer die oordrag, meer die replikasiefoute en dus meer mutasies akkumuleer in die genoom, wat lei tot nuwe variante. Menslike koronavirusse het in die onlangse geskiedenis mutasies opgebou om nuwe variante te skep. Daar was verskeie variante wat verantwoordelik was vir epidemies sedert 1966, toe die eerste episode opgeneem is⁶. Maar hoekom so 'n uitgebreide mutasie in 'n enkele sarsie? Mag wees, omdat B.1.1.529-variant ontwikkel het tydens 'n chroniese infeksie van immuunonderdrukte persoon, moontlik 'n onbehandelde MIV/VIGS-pasiënt⁷.  

Wat ook al die oorsaak van uitgebreide mutasies mag wees, as die vinnige tempo waarteen dit in Suid-Afrika versprei het enige aanduiding is, kan evolusie van hierdie variant 'n geweldige invloed hê op immuniteit, oordraagbaarheid & virulensie en doeltreffendheid van bestaande entstowwe wat tans gebruik word.  

Of die bestaande entstowwe doeltreffend sal bly teen hierdie nuwe variant of as daar meer gevalle van entstof-deurbraakinfeksies sal wees, daar is tans min data beskikbaar om enige gevolgtrekking te maak. In 'n onlangse studie het 'n sintetiese variant met 20 mutasies in die piekproteïen egter byna volledige ontsnapping van teenliggaampies getoon⁷. Dit dui daarop dat die nuwe variant B.1.1.529 met veel meer verhoogde mutasies aansienlik verminderde neutralisasie deur teenliggaampies kan toon. Die nuwe variant blyk egter meer oordraagbaar te wees teen die vinnige tempo waarteen dit die Delta-variant in Suid-Afrika vervang het, hoewel die huidige data nie voldoende genoeg is om enige betroubare skatting te maak nie. Net so is dit nie moontlik om op hierdie stadium kommentaar te lewer oor die erns van simptome nie.  

In die lig van die feit dat Europa reeds die afgelope paar weke met 'n buitengewone hoë aantal COVID 19-gevalle (weens hoogs oordraagbare deltavariant) steier en die vinnige tempo waarteen omikron (B.1.1.529)-variant het onlangs in Suid-Afrika versprei en die delta-variant vervang, verskeie lande in Europa, insluitend die VK, Duitsland en Italië het reisbeperkings ingestel op aankomste vanaf Suid-Afrika en van buurlande soos Botswana, Malawi, Mosambiek, Zambië en Angola. Omdat Israel die ergste vrees, gaan Israel die toegang van besoekers uit alle lande verbied.  

Die wêreld het soveel belê in die ontwikkeling en toediening van COVID-19-entstowwe om mense teen die pandemie te beskerm. Die vraag wat die meeste in die gedagtes van wetenskaplikes en owerhede is, is of die belangrikste COVID-19-entstowwe soos Pfizer–BioNTech, Oxford–AstraZeneca, Moderna, Johnson & Johnson ook effektief sal bly teen Omicron (B.1.1.529) variant. . Dit word aangevuur deur die feit dat deurbraakinfeksies in Suid-Afrika aangemeld is. Die twee Hong Kong-gevalle het ook entstofdosisse ontvang⁹. 

Ontwikkeling van pan-koronavirus-entstowwe¹⁰ (multivalente entstofplatforms¹¹) blyk die behoefte van die uur te wees. Maar, vinniger, kan dit moontlik wees om vinnig skraagdosisse van mRNA en DNA-entstowwe te vervaardig wat die mutasies dek. Daarbenewens het die onlangs goedgekeur antivirale middels (Merck se Molnupiravir en Pfizer se Paxlovid) moet handig wees om mense teen hospitalisasie en sterftes te beskerm.   

 *** 

Verwysings:  

1. WGO 2021. Nuus – Klassifikasie van Omicron (B.1.1.529): SARS-CoV-2 Variant of Concern. Gepubliseer 26 November 2021. Aanlyn beskikbaar by https://www.who.int/news/item/26-11-2021-classification-of-omicron-(b.1.1.529)-sars-cov-2-variant-of-concern  

2. Europese Sentrum vir Siektevoorkoming en -beheer. Implikasies van die ontstaan ​​en verspreiding van die SARSCoV-2 B.1.1. 529 variant van kommer (Omicron), vir die EU/EEA. 26 November 2021. ECDC: Stockholm; 2021. Aanlyn beskikbaar by https://www.ecdc.europa.eu/en/publications-data/threat-assessment-brief-emergence-sars-cov-2-variant-b.1.1.529  

3. UK Govt 2021. Persverklaring – Eerste Britse gevalle van Omicron-variant geïdentifiseer. Gepubliseer 27 November 2021. Beskikbaar by https://www.gov.uk/government/news/first-uk-cases-of-omicron-variant-identified   

4. WIE, 2021. Volg SARS-CoV-2-variante. Aanlyn beskikbaar by https://www.who.int/en/activities/tracking-SARS-CoV-2-variants/ 

5. GitHub, 2021. Thomas Peacock: B.1.1 afstammeling wat met Suider-Afrika geassosieer word met 'n hoë aantal Spike-mutasies #343. Aanlyn beskikbaar by https://github.com/cov-lineages/pango-designation/issues/343 

6. Prasad U.2021. Variante van Coronavirus: wat ons tot dusver weet. Wetenskaplike Europese. Geplaas 12 Julie 2021. Aanlyn beskikbaar by http://scientificeuropean.co.uk/covid-19/variants-of-coronavirus-what-we-know-so-far/ 

7. GAVI 2021. Entstofwerk – Wat weet ons van die nuwe B.1.1.529-koronavirusvariant en moet ons bekommerd wees? Beskikbaar by https://www.gavi.org/vaccineswork/what-we-know-about-new-b11529-coronavirus-variant-so-far 

8. Schmidt, F., Weisblum, Y., Rutkowska, M. et al. Hoë genetiese versperring vir SARS-CoV-2 poliklonale neutraliserende teenliggaampies. Natuur (2021). https://doi.org/10.1038/s41586-021-04005-0 

9. Swaar gemuteerde koronavirusvariant plaas wetenskaplikes op waaksaamheid. Natuur News. Opgedateer 27 November 2021. DOI: https://doi.org/10.1038/d41586-021-03552-w  

10. Soni R. 2021. "Pan-coronavirus"-entstowwe: RNA-polimerase kom as 'n entstofteiken na vore. Wetenskaplike Europese. Gepubliseer 16 November 2021. Beskikbaar by http://scientificeuropean.co.uk/covid-19/pan-coronavirus-vaccines-rna-polymerase-emerges-as-a-vaccine-target/  

11. NIH 2021. Nuusvrystelling - NIAID reik nuwe toekennings uit om "pan-koronavirus"-entstowwe te finansier. Geplaas 28 September 2021. Beskikbaar by https://www.nih.gov/news-events/news-releases/niaid-issues-new-awards-fund-pan-coronavirus-vaccines  

***