SARS-CoV-2: Hoe ernstig is B.1.1.529-variant, nou genaamd Omicron

^{Die B.1.1.529-variant is op 24} November 2021 vir die eerste keer vanuit Suid-Afrika aan die WGO gerapporteer. Die eerste bekende bevestigde B.1.1.529-infeksie was van 'n monster wat op 9 November 2021 versamel is ¹ . ^' n Ander bron ² dui aan dat hierdie variant vir die eerste keer opgespoor is in monsters wat op 11 November 2021 in Botswana en op 14 November 2021 in Suid-Afrika versamel is ^. Sedertdien ^het die aantal COVID-19-gevalle in byna alle provinsies in Suid-Afrika skerp toegeneem. Vanaf 27 ^November 2021 is nuwe gevalle van hierdie variant ook aangemeld in België, Hongkong, Israel, die Verenigde Koninkryk ³ , Duitsland, Italië en die Tsjeggiese Republiek, wat almal reisverwant van oorsprong is.

Dankie aan die Suid-Afrikaanse owerhede dat hulle geen tyd geneem het om te kommunikeer en relevante inligting met die wêreldwye wetenskaplike gemeenskap te deel sodat die WGO se kundige groep op 26 November 2021 kon vergader ^en hierdie variant vinnig as 'n Variant van kommer (VOS) kon aanwys nie. Die erns van die saak kon afgelei word uit die feit dat B.1.1.529 slegs twee dae gelede, op 24 November 2021, as 'n variant onder monitering (VOM) aangewys is ^{voordat dit op 26} November 2021 as VOS aangewys is sonder om eers as 'n variant onder ondersoek (VOI) aangewys te word.

Tabel: SARS-CoV-2-variante van kommer (VOC) soos op 26 November 2021 

Die dringendheid om B.1.1.529 as 'n kommerwekkende variant (VOC) aan te wys, was geregverdig omdat daar gevind is dat hierdie variant die mees uiteenlopende variant van SARS-CoV-2 tot dusver is. In vergelyking met die SARS-CoV-2-virus wat oorspronklik in Wuhan, China, opgespoor is, het dit soveel as 30 aminosuurveranderinge, 3 klein delesies en 1 klein invoeging in die spykerproteïen. Van hierdie veranderinge is 15 in die reseptorbindingsdomein (RBD) geleë, die deel van die virus wat dit toelaat om toegang tot menslike selle te verkry, wat tot infeksie lei. Hierdie variant het ook 'n aantal veranderinge en delesies in ander genomiese streke ² . Die mutasies is so uitgebreid dat 'n mens dit 'n nuwe stam kan noem, in plaas van 'n variant. Die ongelooflik hoë hoeveelheid spykermutasies beteken 'n verhoogde moontlikheid van ontsnapping van bekende teenliggaampies, wat hierdie variant 'n saak van ernstige kommer maak ⁵.

Oorskakeling na nuwe variante is algemeen vir koronavirusse. Dit was nog altyd die aard van dinge dat die koronavirusse teen uiters hoë tempo's mutasie in hul genome ondergaan, as gevolg van 'n gebrek aan proeflees van nuklease-aktiwiteit van hul polimerases; meer die oordrag, meer die replikasiefoute en dus meer mutasies versamel in die genoom, wat lei tot nuwe variante. Menslike koronavirusse het in die onlangse geskiedenis mutasies opgebou om nuwe variante te skep. Daar was verskeie variante verantwoordelik vir epidemies sedert 1966, toe die eerste episode aangeteken is ^6. Maar hoekom so 'n uitgebreide mutasie in 'n enkele uitbarsting? Miskien omdat die B.1.1.529-variant ontwikkel het tydens 'n chroniese infeksie van 'n immuunonderdrukte persoon, moontlik 'n onbehandelde MIV/VIGS-pasiënt ⁷.

Wat ook al die oorsaak van uitgebreide mutasies mag wees, as die vinnige tempo waarteen dit in Suid-Afrika versprei het enige aanduiding is, kan evolusie van hierdie variant 'n geweldige invloed hê op immuniteit, oordraagbaarheid & virulensie en doeltreffendheid van bestaande entstowwe wat tans gebruik word.  

Of die bestaande entstowwe effektief sal bly teen hierdie nuwe variant of dat daar meer gevalle van deurbraakinfeksies deur die entstof sal wees, daar is tans min data beskikbaar om enige gevolgtrekking te maak. In 'n onlangse studie het 'n sintetiese variant met 20 mutasies in die spykerproteïen egter byna volledige ontsnapping van teenliggaampies getoon ^7. Dit dui daarop dat die nuwe variant B.1.1.529, met veel meer verhoogde mutasies, aansienlik verminderde neutralisasie deur teenliggaampies kan toon. Die nuwe variant blyk egter meer oordraagbaar te wees as gevolg van die vinnige tempo waarteen dit die Delta-variant in Suid-Afrika vervang het, hoewel die huidige data nie voldoende genoeg is om enige betroubare skatting te maak nie. Net so is dit nie moontlik om op hierdie stadium kommentaar te lewer oor die erns van simptome nie.

In die lig van die feit dat Europa reeds die afgelope paar weke met 'n buitengewoon hoë aantal COVID-19-gevalle (as gevolg van die hoogs oordraagbare delta-variant) gebuk gaan en die vinnige tempo waarteen die Omicron (B.1.1.529)-variant in Suid-Afrika versprei het en onlangs die delta-variant vervang het, het verskeie lande in Europa, insluitend die VK, Duitsland en Italië, reisbeperkings ingestel op aankomelinge uit Suid-Afrika en uit buurlande soos Botswana, Malawi, Mosambiek, Zambië en Angola. Uit vrees vir die ergste gaan Israel die toegang van besoekers uit alle lande verbied.

Die wêreld het soveel belê in die ontwikkeling en toediening van COVID-19-entstowwe om mense teen die pandemie te beskerm. Die vraag wat wetenskaplikes en owerhede boaan die hart lê, is of die belangrikste COVID-19-entstowwe soos Pfizer-BioNTech, Oxford-AstraZeneca, Moderna, Johnson & Johnson ook teen die Omicron (B.1.1.529)-variant effektief sal bly. Dit word aangevuur deur die feit dat deurbraakinfeksies in Suid-Afrika aangemeld is. Die twee gevalle in Hongkong het ook entstofdosisse ^ontvang.

Die ontwikkeling van "pan-koronavirus"-entstowwe ¹⁰ (multivalente entstofplatforms ¹¹ ) blyk die noodsaaklikheid van die uur te wees. Maar vinniger kan dit moontlik wees om vinnig boosterdosisse van mRNA- en DNA-entstowwe te vervaardig wat die mutasies dek. Daarbenewens behoort die onlangs goedgekeurde antivirale middels (Merck se Molnupiravir en Pfizer se Paxlovid) handig te pas te kom om mense teen hospitalisasie en sterftes te beskerm.

 *** 

Verwysings:  

1. WGO 2021. Nuus – Klassifikasie van Omicron (B.1.1.529): SARS-CoV-2 Variant of Concern. Gepubliseer 26 November 2021. Aanlyn beskikbaar by https://www.who.int/news/item/26-11-2021-classification-of-omicron-(b.1.1.529)-sars-cov-2-variant-of-concern  

2. Europese Sentrum vir Siektevoorkoming en -beheer. Implikasies van die ontstaan ​​en verspreiding van die SARSCoV-2 B.1.1. 529 variant van kommer (Omicron), vir die EU/EEA. 26 November 2021. ECDC: Stockholm; 2021. Aanlyn beskikbaar by https://www.ecdc.europa.eu/en/publications-data/threat-assessment-brief-emergence-sars-cov-2-variant-b.1.1.529  

3. UK Govt 2021. Persverklaring – Eerste Britse gevalle van Omicron-variant geïdentifiseer. Gepubliseer 27 November 2021. Beskikbaar by https://www.gov.uk/government/news/first-uk-cases-of-omicron-variant-identified   

4. WIE, 2021. Volg SARS-CoV-2-variante. Aanlyn beskikbaar by https://www.who.int/en/activities/tracking-SARS-CoV-2-variants/ 

5. GitHub, 2021. Thomas Peacock: B.1.1 afstammeling wat met Suider-Afrika geassosieer word met 'n hoë aantal Spike-mutasies #343. Aanlyn beskikbaar by https://github.com/cov-lineages/pango-designation/issues/343 

6. Prasad U.2021. Variante van Coronavirus: wat ons tot dusver weet. Wetenskaplike Europese. Geplaas 12 Julie 2021. Aanlyn beskikbaar by http://scientificeuropean.co.uk/covid-19/variants-of-coronavirus-what-we-know-so-far/ 

7. GAVI 2021. Entstofwerk – Wat weet ons van die nuwe B.1.1.529-koronavirusvariant en moet ons bekommerd wees? Beskikbaar by https://www.gavi.org/vaccineswork/what-we-know-about-new-b11529-coronavirus-variant-so-far 

8. Schmidt, F., Weisblum, Y., Rutkowska, M. et al. Hoë genetiese versperring vir SARS-CoV-2 poliklonale neutraliserende teenliggaampies. Natuur (2021). https://doi.org/10.1038/s41586-021-04005-0 

9. Swaar gemuteerde koronavirusvariant plaas wetenskaplikes op waaksaamheid. Natuur News. Opgedateer 27 November 2021. DOI: https://doi.org/10.1038/d41586-021-03552-w  

10. Soni R. 2021. "Pan-coronavirus"-entstowwe: RNA-polimerase kom as 'n entstofteiken na vore. Wetenskaplike Europese. Gepubliseer 16 November 2021. Beskikbaar by http://scientificeuropean.co.uk/covid-19/pan-coronavirus-vaccines-rna-polymerase-emerges-as-a-vaccine-target/  

11. NIH 2021. Nuusvrystelling - NIAID reik nuwe toekennings uit om "pan-koronavirus"-entstowwe te finansier. Geplaas 28 September 2021. Beskikbaar by https://www.nih.gov/news-events/news-releases/niaid-issues-new-awards-fund-pan-coronavirus-vaccines  

***