Die toetstyd word aansienlik verminder van ongeveer 'n uur tot 'n paar minute deur die nuutgerapporteerde RTF-EXPAR-metode wat omgekeerde transkriptase-vrye (RTF) benadering gebruik vir omskakeling van RNA in DNA gevolg deur EXPAR (Eksponensiële Amplifikasie Reaksie) vir amplifikasie by enkel temperatuur.
Beheer van die tempo van Covid-19 verspreiding vereis 'n akkurate en 'n vinniger virustoetsstrategie. RT-PCR (omgekeerde transkriptase polimerase kettingreaksie), die mees akkurate toetsmetode wat tans gebruik word, is 'n tweestap toets wat ongeveer 60 minute per monster neem.
Die navorsers van die Universiteit van Birmingham het 'n nuwe metode vir die opsporing van SARS-CoV-2 aangemeld. Dit kan baie vinniger toetsing moontlik maak en is voldoende sensitief.
Die virale RNA opsporing deur RT-PCR (omgekeerde transkriptase polimerase kettingreaksie) behels omskakeling van virale RNA na komplementêre DNA (cDNA) gevolg deur amplifikasie van cDNA deur 'n kwantitatiewe PCR (qPCR). Die cDNA word dan opgespoor met behulp van 'n fluoresserende kleurstof. Dit neem tot 'n uur.
Die toetstyd word aansienlik verminder van ongeveer 'n uur tot 'n paar minute deur die nuutgerapporteerde RTF-EXPAR-metode wat omgekeerde transkriptase-vrye (RTF) benadering gebruik vir omskakeling van RNA in DNA gevolg deur EXPAR (Eksponensiële Amplifikasie Reaksie) vir amplifikasie by enkel temperatuur. Die versterking wat by 'n enkele temperatuur plaasvind, is die sleutel tot spoed, want dit vermy lang verhitting- en verkoelingsstappe van RT-PCR. Verder is die gedeelte van DNA wat geamplifiseer word kleiner in vergelyking met RT-PCR. Gevolglik genereer EXPAR tot 108 stringe DNA-produk in 'n paar minute. Die dupleksvorming word gemonitor, soos in RT-PCR-metode met fluoresserende kleurstof, SYBR Green.
Interessant genoeg kan die nuwe metode aangepas word om verskeie ander aansteeklike siektes op te spoor wat deur RNA-virusse veroorsaak word, byvoorbeeld Ebola, RSV, ens.
Bronne):
Carter et al (2020). Sub-5 minute opsporing van SARS-CoV-2 RNA met behulp van 'n omgekeerde transkriptase-vrye eksponensiële amplifikasiereaksie, RTF-EXPAR. Voordruk. Gepubliseer by medRxiv Geplaas 04 Januarie 2021. DOI: https://doi.org/10.1101/2020.12.31.20248236
***
